Moosseedorf est une commune suisse du canton de Berne, située dans l'arrondissement administratif de Berne-Mittelland. Le village est situé au sud du lac éponyme Moossee.

La plus ancienne occurrence du toponyme, Sedorf ("village au bord du lac" en allemand), date de 1242, tandis que Mossedorf apparaît pour la première fois dans un document de 1389.

Moossee (littéralement, lac marécageux) étant le nom du lac voisin, on peut considérer que Moosseedorf signifie tout simplement "village du lac marécageux". Les seigneurs locaux de l'époque, qui avaient un château aujourd'hui disparu au bord du lac, s'appelant également Moser (soit celui qui vient d'un marais ou d'un endroit boueux), on peut aussi rattacher le nom de la localité aux anciens chevaliers Moser (soit village des Moser).

En tout état de cause, la commune prit officiellement le nom de Mooseedorf autour de 1800, pour la distinguer de Seedorf, située à une quinzaine de kilomètres à l'ouest dans le district voisin.