Les détectives animaliers Judy Hopps et Nick Wilde tombent sur la piste énigmatique d'un mystérieux reptile qui fait son apparition à Zoomania et met la métropole sens dessus dessous : Gary De'Snake ! Pour résoudre l'affaire, les deux détectives doivent s'infiltrer dans des quartiers totalement inconnus, ce qui met leur partenariat naissant à rude épreuve.

Bob l'éponge, qui souhaite enfin faire partie des grands et prouver son courage à M. Krabs, suit le Hollandais volant, un mystérieux et audacieux pirate fantôme. C'est ainsi que commence une aventure maritime trépidante et drôle qui le mène dans les profondeurs les plus insondables de la mer, où aucune éponge n'est jamais allée auparavant.