La stazione di Mendrisio è una stazione ferroviaria posta sulle linee ferroviarie Mendrisio-Malnate Olona, Mendrisio-Stabio e Chiasso -Immensee (ferrovia del Gottardo). La stazione è a servizio dell'omonima città. L'impianto è gestito dalle Ferrovie Federali Svizzere (FFS).

La stazione fu aperta nel 1882.

Dal 1926 al 1928 la stazione fu capolinea della ferrovia Castellanza-Valmorea-Stabio-Mendrisio. Nel 1928 la linea da Mendrisio a Valmorea fu soppressa ma in territorio svizzero la ferrovia rimase in uso solo per il servizio merci.

Tra il 1995 e il 2007, fu riaperta (per fini turistici) la linea da Stabio a Malnate Olona.

Dal 1º dicembre 2008 al 31 maggio 2014 la tratta Mendrisio-Stabio fu coinvolta nei lavori di raddoppio e elettrificazione connessi alla nuova ferrovia Mendrisio-Varese .