Quasi tre decenni dopo lo scoppio del virus Rage, è ancora in vigore una rigida quarantena. Un piccolo gruppo di sopravvissuti vive in isolamento su un'isola che è collegata alla terraferma solo da una strada rialzata pesantemente protetta. Quando un residente lascia la sicurezza dell'isola, scopre non solo mostri al di là della diga, ma anche oscure verità sull'umanità.

Sull'isola di Berk, dove da secoli esiste un'aspra inimicizia tra vichinghi e draghi, Hiccup, l'esile e spesso sottovalutato figlio del capo tribù Haudrauf, è visto come un estraneo. Ma quando scopre il drago Sdentato ferito e fa amicizia con lui, stravolge l'intera visione del mondo dei vichinghi.

Sta sorgendo una nuova era. Dopo gli eventi di Isla Nublar, i dinosauri hanno condiviso il mondo con gli esseri umani. Cinque anni dopo, però, l'ecologia del pianeta è cambiata radicalmente e i dinosauri sono costretti a ritirarsi in ambienti equatoriali isolati.