Guttannen sorge nell'Oberland Bernese in prossimità del Passo del Grimsel. Il fiume Aar nasce dai ghiacciai presenti nei dintorni. Sono presenti quattro laghi artificiali nel territorio comunale: Oberaarsee, Grimselsee, Räterichsbodensee e Gelmersee. Nella parte occidentale del territorio di Guttannen sono presenti alcune delle più alte e famose montagne delle Alpi Bernesi, tra le quali il Finsteraarhorn (4 274 m s.l.m.), lo Schreckhorn (4 078 m s.l.m.) e il Lauteraarhorn (4 042 m s.l.m.).
Guttannen si estende per 200,7 km², superficie superiore addirittura quella del Canton Appenzello Interno.