Printemps 2020 au Nouveau-Mexique. La pandémie touche également la petite ville endormie d'Eddington. Le shérif Joe Cross et le maire Ted Garcia s'affrontent dans une lutte qui menace de déchirer la ville. Lorsqu'un meurtre vient bouleverser le fragile équilibre, la violence fait son apparition.

Les préparatifs de vacances vertigineux d'une famille de souris sont brusquement interrompus lorsqu'une famille humaine de la ville annonce son arrivée. Dans une lutte de pouvoir épique entre souris et humains, la question suivante se pose : qui est le nuisible?